Te comento mis experiencias:
1.- Hasta el sol de hoy, todas mis actualizaciones a versiones recientes las he echo de 0. Esto es que desinstalo todo y procuro borrar inclusive la carpeta SAP creada en la versión que estas abanonando. OJO- asegúrate de no dejar nada que te pueda servir para tu nueva versión como documentos exportados o algo parecido. Después de eso, instalo la versión a la que quiero migrar en su PL base y después aplico el UPGRADE.
2.- Yo me encontraba hasta hace 2 semanas en el SAP 8.8 sp0 pl21, y lo migre a la versión 9 sp0 pl8 y estoy trabajando sin problemas.
espero te sirva la info.